蓝藻是最原始、最古老的藻类，蓝藻能进行光合自养，没有细胞核、色素体、线粒体及内质网，其细胞壁的主要组成是粘缩肽，与细菌相似，也称蓝细菌。
蓝藻有以下生物学特征：（1）蓝藻个体微小，但比表面积较大，对水体中各种营养素的吸收能力也越强，特别是在水体微量元素缺乏的情况下，许多个体体积大、比表面积小的藻类就失去了竞争能力，无法生存和生长。
（2）蓝藻拥有碳酸酐酶，一种催化水体中溶解的碳酸氢根分解为二氧化碳和水的酶，因而蓝藻具有极高的二氧化碳亲和力，特别是在水中二氧化碳不足时，使其比其他藻类以更高速度进行光合作用，不断繁殖，现成优势藻类。
（3）蓝藻具有固氮酶系，赋予蓝藻在氮、磷、钾失衡的条件下具有较强的生长能力。特别是在藻类密度大、透光层浅的静态水中，氮、磷、钾往往失衡，使蓝藻比其他藻类具有更强的生存能力和生长速度。
（4）蓝藻拥有完善的光氧化保护系统，赋予蓝藻具有强大的抗逆境的生存能力。当水体中无机碳不足时，不能满足卡尔文循环的暗反应时，蓝藻体内经一系列代谢后产生具有很强细胞毒性的过氧化氢，蓝藻具有完善的光氧化保护，保护本身不受过氧化氢影响，而其他藻类因过氧化氢中毒而死亡。
（5）蓝藻具有伪空泡特征。伪空泡可调节藻类在水体中浮力，在太阳出来之后，蓝藻可借助伪空泡的浮力作用快速上升到最佳光合作用光照强度的位置，有利于争夺光源和空间。
（6）藻毒素。绝大数蓝藻处于不良环境下特别是在濒临死亡时会分泌藻毒素，不仅毒死滤食性生物，避免被摄食，而且还抑制其它藻类繁殖和生长，从而独占资源。大量繁殖的结果导致池塘生态系统破坏，生态循环中断，自身老化死亡。
二、蓝藻爆发的原因1、主要原因是水体的富营养化，简单点说就是水体中氮磷钾等营养物质比例失衡。水产养殖一段时间后，随着饲喂量加大，水体中的粪便也增多，导致水体中氮磷含量增多，进而促进蓝藻生长。
2、蓝藻的大规模爆发一般发生在高温季节，水温较低时，蓝藻爆发的概率小些，进入夏季，天气晴朗、无风、光线强，在富营养水中，如果养殖池塘中有蓝藻藻种，就会大量繁殖，形成优势种。
3、有些水产养殖过程中会引入外源水，外源水体中蓝藻含量偏多，引入养殖池水中后容易引起蓝藻爆发。
在养殖过程中，如果饲料投入量大于池塘自净能力，必然引起池塘水体富营养化，在养殖中后期大部分池塘都处于营养过剩状态，但水体的营养组成又往往处于不平衡状态。在营养过剩和营养不平衡条件下，蓝藻具有独特的生存生长优势，环境越恶劣，蓝藻就越有优势。所以，如果养殖户不能很好地解决这两个问题，池塘滋生蓝藻是不可避免的。
三、蓝藻的危害1、蓝藻过度繁殖，代谢期间分泌的藻毒素会抑制其它藻类生长，对养殖动物产生毒害作用，影响养殖动物的正常生长。
2、蓝藻过度繁殖，白天光照强度大，表层溶氧过饱和，夜间蓝藻下沉，大量消耗中下层溶氧，造成底部严重缺氧。
3、蓝藻生长快，爆发快，但是生命周期短，死亡后形成水华，败坏水质，产生毒素、亚盐、硫化氢等有害物质，且分解需要大量耗氧。
4、蓝藻过多会影响养殖动物的正常呼吸和摄食。
5、过多的蓝藻会降低水体的透明度，不利于池塘中水草对光照的接收，影响水草及其他藻类的生长。
四、蓝藻的预防在养殖过程中，蓝藻的治理，应该注重“以防为主，以治为辅”为原则。
1、选择合理的养殖密度，合理地投喂，避免因池塘承载量过大，导致有机物过多、过剩的情况。
2、高温天气，容易爆发蓝藻，阴雨天气易倒藻，其它藻类容易死亡，由于蓝藻抗逆性较强，存活下来再大量繁殖，就一发不可收拾了。所以，我们可以在阴雨天前适当地肥水并泼洒抗应激药物。
3、加大肥水，平衡水体营养元素，定期使用酵素肥，促进池塘中绿藻、硅藻等有益藻类的繁殖生长，从而抑制蓝藻的生长。
4、定期使用改底和调水类产品，保证池塘底部环境的良好和水体中菌藻相的平衡。
5、定期使用有机酸调水解毒类产品，有利于稳定水体酸碱度，控制过高PH。
6、高温天气，多补充碳源，促进菌类生长，控制PH过高。采取“晴用芽孢，阴雨EM菌种”的方案，芽孢在晴天使用本身可以与蓝藻竞争，同时其分泌的多肽类物资具有抗菌作用，能较好的抑制蓝藻。在阴雨天其它菌种和藻类繁殖减慢的时候使用光合细菌可以对蓝藻形成很好的竞争抑制作用。
7、如果外源水比较好时，可以定期的换水。
五、爆发后的治理蓝藻爆发后也不必担心，更不用化工类的杀蓝藻之类的药物，按照以下方法治理：
1、查看外源水情况，如果外源水情况相对较好，直接进行大量的换水，这样处理成本较低。
2、使用生物制杀蓝藻药，安全可靠。用化学的方法直接杀死的蓝藻易产生藻毒素，污染水体，水质恶化，严重毒害养殖动物，诱发疾病，影响摄食、生长、发育。“蓝立静”酶制剂、复合菌群等，
用于控制养殖池塘中蓝藻形成的水华，改善水质，清爽水体，保持良好的水生态环境；缓解由于蓝藻爆发而引起的水生动物会出现厌食、行动无力、虾出现偷死、螃蟹上岸等现象；降低因蓝藻爆发引起升高的pH值、氨氮、亚硝酸盐等水体指标，稳定和控制水体中菌藻平衡。
对虾蟹塘的水草无伤害，生物除蓝藻，无药物残留，安全高效。
3、利用菌藻相互竞争、抑制作用，可以使用芽孢+EM菌，达到调控蓝藻、抑制蓝藻的效果。
4、治理蓝藻的案例：
（1）杀蓝藻一定要全天开增氧机，在早上杀较好。
（2）如果杀蓝藻后水变清，晚上要用增氧片。
（3）下午用复合有机酸-超能解毒灵解毒，肥水，用藻多多，培小球藻，可以加些新水，培养其他藻类。
（4）第二天用芽孢，EM菌等。
治理蓝藻后第三天的水色
严格控制轮虫，枝角类等浮游动物的数量；用微生物制剂抑制蓝藻的繁殖；在施用微生物制剂的基础上，加大肥水力度，平衡水体营养元素，加快有益藻的繁殖；在蓝藻暴发期间，请专业技术人员对所进水源进行仔细检查后，再进水；可以向池中泼洒解毒药品如“水博士、解毒灵”，以缓解蓝藻的毒性。
总之，蓝藻的治理，预防才是关键。
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