反硝化细菌是一种非常好的生物改底产品。它可以把池塘底部的氮直接转化成氮气，排除水体之外，是最彻底的去除总氮的微生物制剂。
反硝化细菌在厌氧环境下作用明显，它需要有机碳源，所以要搭配发酵的有机碳源或者红糖使用。
1，养殖进行一段时间，水体有了一定的肥度。也就是藻类有一定的稳定性的时候，可以考虑使用。这个时候，底质厌氧层并不厚，底泥翻出来的有害物质也不会太多，水体中的菌藻足以消化掉，不会给水体带来负担。
2，使用前先一两天，用乳酸菌，或少量的芽孢进一步提高水体的洁净能力。
3，一定要先少量使用，根据水体的氨氮，亚盐，溶氧情况，溶氧不好一定要先解决溶氧再少量使用。使用反硝化细菌会产生一部分含氮气体，避免不了的会翻动底泥，是很多的有机营养物质大量的进入水体，会损耗一部分溶氧。
4，养殖中后期，或者底泥比较厚的老塘口，更要慎重使用，即使是化学改底产品也是一样，少量多次。否则易翻塘。造成养殖生物的死亡。如果是老塘口，可以在清塘，晒塘之后，先使用反硝化细菌，改良底质，释放营养物质，然后再使用藻种定向培养藻类。往往可以获得一塘好水。
5，由于反硝化细菌可以将水体，底泥中的氮元素，变成氮气，直接排出到空气中，所以，会大量的减少有机碳和硝酸盐，根据池塘的具体情况。可能会影响到ph值略微升高，要
